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如果苹果手机中的短信丢失，并且想要通过恢复出厂设置来尝试恢复，可以参考以下步骤。
1、备份数据：在进行恢复出厂设置之前，请确保已备份所有重要数据，包括通讯录、照片、备忘录等，可以使用iCloud或iTunes进行备份，以避免在恢复出厂设置后丢失这些数据。
2、恢复出厂设置：
在iPhone上依次进入“设置”-“通用”-“还原”。
选择“抹掉所有内容和设置”，这将会删除iPhone上的所有数据和设置，并还原到出厂状态，此操作不可逆，一旦执行，所有数据将被永久删除。
输入锁屏密码以确认操作。
3、数据恢复：
在恢复出厂设置后，可以尝试从iCloud备份中恢复数据，进入“设置”-“iCloud”，然后开启需要的备份项目，iCloud云备份”，连接Wi-Fi后，点击“立即备份”，即可开始恢复数据。
若已使用iTunes备份，可以使用iTunes从备份中恢复短信和其他数据。
需要明确的是，短信属于非永久性删除的数据，如果在恢复出厂设置前没有进行相应的备份，那么很可能无法恢复，为了确保数据安全，建议定期备份重要数据。
如果仍然无法恢复短信，或者操作过程中遇到任何问题，建议咨询苹果官方客服或前往附近的苹果专卖店获取帮助。